Han kom i mål på tempoetappen på 36.31, 22 sekunder bak bronsemedaljen som ble tatt av lagkamerat Iver Knotten.
Franske Alexys Brunel vant gullet på tiden 35.58.
Leknessund var på forhånd spådd å kjempe i toppen på tempoetappen.
– På en bra dag skal han være med å kjempe om medalje, sa sportssjef Hans Falck i Norsk Cykleforbund tidligere i september.
Fredag venter fellesstart der Leknessund og fem andre norske skal delta.
– På fellesstarten har vi sterkt lag som kan prestere med flere ulike rittutviklinger, sa Falk.