Simon Yates overtok den rosa ledertrøya.
Chaves tok sin annen etappeseier i årets ritt. Hans britiske lagkamerat Yates tråkket seg opp til ham på den siste kilometeren og ble belønnet med sammenlagtledelse.
Thibaut Pinot fra FDJ-laget tok tredjeplassen et snaut halvminutt bak tetduoen. Chris Froome, som er regjerende mester i de to andre Grand Tour-rittene, kom til mål på 10.-plass i samme gruppe som Pinot.
I sammendraget klatret Yates fra tredje- til førsteplass. Han er nå 16 sekunder foran Tom Dumoulin og 26 foran Chaves.
Froome er inne blant de ti beste sammenlagt. Han er ikke mer enn 1.01 minutt bak lederen.
(©NTB)